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我國肉牛功能基因組學研究取得新進展

我國肉牛功能基因組學研究取得新進展

日期:2015年09月02日 來源:科技部

 

我國是世界上牛品種資源最為豐富的國家,秦川牛、魯西牛等地方牛品種(系)代表了我國優良的牛品種(系)。為進一步挖掘我國地方黃牛優異種質資源,解析重要經濟性狀形成的分子機制,加快我國特色優異肉牛新品種選育進程,2013年科技部863計劃現代農業技術領域啟動了“中國肉牛重要經濟性狀功能基因組學研究”課題,近日科技部863計劃現代農業技術領域辦,組織有關專家對“中國肉牛重要經濟性狀功能基因組學研究”課題進行了中期檢查。

“中國肉牛重要經濟性狀功能基因組學研究”課題自2013年啟動以來,課題組利用基因組重測序等功能基因組學方法,對秦川牛肉用新品系、魯西牛、南陽牛、延邊牛、雷瓊牛、云南黃牛、大額牛等8個地方牛品種(系)及黑毛和牛、紅安格斯牛等2個國外培育肉牛品種共88個樣本進行了基因組解析,獲得了51.86M SNPs和4.82Mindel,進而從基因組水平揭示了我國地方黃牛品種在8000年的演化歷史中,明顯受到了瘤牛血統的影響。同時,通過比較基因組學分析,課題組發現:相比國外肉牛品種,以秦川牛為代表的地方黃牛在長期馴化過程中,以SPTBN5為代表的免疫應答相關基因得到了明顯正選擇,這很好的解釋了我國地方黃牛抗逆性狀的形成機制;以BBS2和LTA4H等為代表的與脂代謝和肌肉發育相關的基因在和牛中受到強烈選擇,表明黑毛和牛肉用性能在長期選育過程中得到明顯提高。此外,課題組還完成了15頭野生牦牛和65頭家養牦牛5X基因組覆蓋度重測序,新鑒定SNP 714萬個,在1910個可能受人工選擇區域中,80%定位到了黃牛中已經識別的產肉、產奶等QTL上。上述研究為我國地方黃牛肉用選育改良、分子育種及牦牛的DNA標記輔助選擇育種研究提供重要依據,奠定了良好基礎。

中期檢查期間,專家組認真聽取了課題匯報,審閱了相關資料,考察了課題實施現場,專家組一致認為“中國肉牛重要經濟性狀功能基因組學研究”課題研究思路清晰、方法得當,取得了重要階段性成果,為完成課題任務目標奠定了良好基礎。同時,專家組建議課題進一步凝練研究方向,加強對具有重大應用潛能的基因和SNPs的深入研究,并在功能研究的基礎上,推進這些基因和分子標記在肉牛生產上的應用。

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